微生物组学分析研讨班

生物 微生物组学

会议说明

本次课程时间:   上午:9:30-11:30下午:13:30-17:00

第一天

上午
微生物组学研究的发展和挑战
1、微生物组研究的发展历史
2、测序平台介绍
3、基于测序的研究方法
3.1 宏基因组(target sequencing 和全基因组)
3.2 单个微生物de novo测序
4、应用案例分析
第一天
下午
target sequencing数据分析
1、linux常用命令使用和上机操作
2、数据分析过程中的编程简介(perl、R、python等)
3、target sequencing数据分析加上机
3.1质控
3.2去嵌合体
3.3 OTU聚类
3.4 注释
3.5统计分析:(1)α多样性分析;(2)β多样性分析;(3)群落结构及丰度分析;(4)进化分析;(5)差异分析(Lefse);(6)功能分析(picrust)。
第二天
全天
Whole metagenome 和metatranscriptome数据分析
1、质控
2、拼接组装:SOAPdenovo;MetaVelvet; Meta-IDBA等
3、聚类Binning:TETRA; MetaCluster; Phymm等
4、基因注释:FragGeneScan;MetaGeneMark;MetaGeneAnnotator等
5、功能注释:RAMMCAP;Blast等
6、统计分析:(1)物种分析;(2)功能分析;(3)差异分析;(4)表达分析
第三天
全天
微生物de novo测序分析
1、 质控
2、 单细胞测序去污染、去嵌合体等
3、拼接组装:SPAdes等
4、基因预测
5、功能注释
6、代谢途径分析
7、进化分析:(1)SNP;(2)插入缺失(3)水平基因转移;
8、转录组分析:(1)基因差异表达分析;(2)代谢通路分析
(课程内容以实际授课为准)

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。

报名费用

注册费:3500元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。

付费方式

现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937 

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)

报名优惠政策

1、1.20日前预报名的学员每人可优惠300元,

   2、3人以上团体报名每人可减少300元;

   3、4+1团报,可免费赠送一个名额

   4、 同时报2个以上培训班的可额外优惠200元               

   5、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

请联系:

QQ:2814500767

于老师   010-59341771,15600660904,yurt@bcc.ac.cn

员老师   010-59341773, 邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

主办方

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

时间\地点

时间:2017年2月20日 -2017年2月22日
地点:北京  北京海淀区丰贤中路7号3号楼